3DS og 2DS bruger forskellige patroner. Mens nogle 3DS-spil måske fungerer på en 2DS, er det omvendte ikke sandt.
Her er hvorfor:
* Forskellige patronstørrelser: 3DS-patronen er lidt større end 2DS-patronen.
* Hardwarekompatibilitet: 3DS har en anden hardwarearkitektur end 2DS, og spil er specielt designet til den respektive hardware.
Derfor vil et forsøg på at indsætte en 2DS-spilpatron i en 3DS sandsynligvis resultere i, at patronen ikke passer korrekt og ikke bliver genkendt af systemet.