Hvad er virkningerne af en alkalisk pH-værdi på DNA-strukturen

? Normalt hvert DNA -molekyle inde i dine celler indeholder to strenge sammen af ​​interaktioner kaldes hydrogenbindinger. Ændring i forhold , dog kan " denaturere " DNA og forårsage disse tråde til at adskille . Tilføjelse af stærke baser , såsom NaOH, dramatisk øger pH således mindske brintionkoncentration af opløsningen og denaturering dobbeltstrenget DNA. Effekter af pH

hydroxidionkilde koncentration og pH Den har en direkte korrelation, hvilket betyder, at højere pH , desto højere hydroxidet koncentration. Ligeledes lavere brintionkoncentration falder. Ved høj pH , så opløsningen er rig på hydroxidioner , og disse negativt ladede ioner kan trække hydrogenioner off af molekyler som basepar i DNA . Denne proces forstyrrer hydrogenbindingen , der holder de to DNA-strenge sammen , får dem til at adskille .
RNA vs DNA

modsætning RNA, DNA mangler en hydroxylgruppe på 2 ' position i hvert sukker gruppe. Denne forskel gør DNA meget mere stabil i basisk opløsning . I RNA, kan hydroxylgruppen i 2'-positionen opgive en hydrogenion til opløsningen ved høj pH-værdi , hvilket skaber en meget reaktive alkoxid -ion , der angriber phosphatgruppen holder to tilstødende nukleotider sammen. DNA ikke lider af denne defekt og dermed nyder bemærkelsesværdig stabilitet ved høj pH .

Alkaline Lysis

Molekylærbiologer ofte gør brug af alkalisk denaturering at isolere plasmid DNA fra bakterier. Plasmider er små løkker af DNA adskilt fra det bakterielle kromosom . I basisk lysis miniprep , biologer tilføje vaskemiddel og natriumhydroxid til bakterier suspenderet i opløsning . Detergentet opløser bakteriecellemembranen mens natriumhydroxid øger pH og gør løsningen stærkt alkalisk . Da de ødelagte celler frigive deres indhold , DNA'et inde deles i sine tråde, eller denaturerer .
Reannealing

Når biologen udtrækker DNA fra cellen , han tilføjer en anden reagens for at returnere opløsningen til en mere neutral pH og udfældning af detergent. Ændringen i pH tillader plasmidet strengene reanneale; voluminøse kromosom , kan dog ikke gøre det samme , så biologen kan fjerne den sammen med rengøringsmiddel , denaturerede proteiner og andre assorterede junk , forlader plasmid bag . Alkalisk lysis ikke fuldstændigt at rense plasmid-DNA; snarere , det tjener som et "quick and dirty" måde at udtrække det fra cellen og fjerne de fleste andre forurenende stoffer.
hoteltilbud